Der Fortschritt ist nicht aufzuhalten.

Es ist das Jahr 2029, und mechanisch augmentierte Menschen sind jetzt Verbannte, ausgegrenzt vom Rest der Gesellschaft.

Als mittlerweile erfahrener Geheimagent ist Adam Jensen nun gezwungen, in einem Umfeld zu arbeiten, in dem seinesgleichen verachtet wird. Mit Hilfe eines neuen Arsenals modernster Waffen und Augmentierungen muss er herausfinden, wie er am besten vorgeht und wem er vertrauen kann, um eine gewaltige, weltweite Verschwörung aufzudecken.